Покупатель сможет применить вычет НДС.
При продаже импортного товара в счете-фактуре требуется указывать номер таможенной декларации (подп. «л» п. 2 приложения 1 к постановлению Правительства от 26.12.2011 № 1137, письмо Минфина от 16.08.2017 № 03-07-09/52531). Но этого номера может и не быть. Такое случается при покупке бывшего в употреблении оборудования, ведь документы по налоговому учету необходимо хранить пять лет (подп. 8 п. 1 ст. 23, подп. 5 п. 3 ст. 24 НК). Но если номер указан неверно или его нет, то покупатель не несет за это ответственности и может принять НДС к вычету (п. 2 ст. 169 НК, постановление ФАС Московского округа от 22.03.2017 № Ф05-2626/2017). То же касается и цифрового кода страны. Если он не совпадает с наименованием страны или его нет, то это не является основанием для отказа в вычете (письмо ФНС от 04.09.2012 № ЕД-4-3/14705).